Kostnader for prosjektet er estimert til:
Trondheimsparsellen: 2750 mill kr.
Stjørdalsparsellen: 750 mill kr.
Totalkostnad: 3,5 mrd (2008 kr).
I tillegg kommer Pirbrua: ca. 150 mill kr.
I følge
Nasjonal Transportplan
var det foreslått at 60 % av kostnadene finansieres gjennom bompenger og 40 % gjennom statlige midler ut fra kostnadstall
som forelå ved siste fastsettelse av NTP. Etter ny kostnadsgjennomgang med nye elementer innlagt i prosjektet er kostnadene
økt betydelig. Det legges opp til en snarest mulig oppstart av prosjektet - dette betyr at den stalige finansieringsandelen
blir fast (kr 730 mill). Dette gir knapt 20% statlig finansiering. Det legges opp til en felles finansiering av prosjektene
av delparsellene der bompengeandelen finansieres gjennom bompengestasjonene på Ranheim, Leistad og Hommelvik. Disse forutsettes
beholdt til prosjektet er nedbetalt.
Endelig plan for finansiering med bompenger ble godkjent i Stortinget 26. februar 2009 i en egen proposisjon.
Pirbrua kommer altså i tillegg med ca. 150 mill 2008-kr, herav ca. 80 mill. statlige midler.